Registro correcto de pago de ISO

Buenos días, tengo un caso atípico con el ISO y quiero solicitar su apoyo, Una sociedad esta en la opcion b) que permite la ley del ISO, es decir ISR acreditable a ISO, resulta que solo en el primer trimestre generó renta imponible para efectuar pago de ISR, este cubrió el primero y segundo trimestre de ISO, para el tercer trimestre de ISO se realizó el pago. Lógicamente el ISR se aprovechó para pagar ISO de dos trimestres, por lo tanto no procede reclamar pago en exceso de ISR, pero tanto el ISO pagado con ISR como el pagado directamente se debe registrar como gasto deducible en el período?