Buen día
En adición a la expresado por el Lic @Hugo_R_Gonzalez_B
Es un tema extenso, no hay respuesta corta
Las entidades que se dedican a la construcción o desarrollo inmobiliario, generalmente utilizan un software especializado (sistema contable integrado) el cual les permite crear los proyectos y su presupuesto (estimaciones, avance de la obra, actividades, costos), a efecto de obtener reportes específicos, como ejecución del presupuesto (costos reales versus lo presupuestado)
Preguntas 1 y 2, los anticipos, técnicamente se le conoce como Estimaciones, las cuales se facturan, ejemplo: primera estimación (20% del avance de la obra) proyecto xyz, esta forma es la más conveniente (financiera y fiscalmente),
Pregunta 3:
Depende sin son actividades de construcción o trabajos, sobre inmuebles propios o Cuando son actividades de construcción o trabajos, sobre inmuebles propiedad de terceros.
Respecto al ISR (Trimestral u Anual) dependerá del método elegido (devengado o percibido) conforme el artículo 34 de la Ley de Actualización Tributaria – LAT –
En el caso de lotificadoras los ingresos deber ser declarados por el sistema de lo percibido, conforme el artículo 35 de la LAT
Una perspectiva general sobre este tema fue publicado en la Revista 182 del IGCPA: Auditoria y Finanzas
Revista 183 del IGCPA, Auditoria y Finanzas, segunda parte
El tratamiento fiscal esta desarrollado en una presentación de CenSAT, la cual puede ser descagado en el siguiente enlace:
https://jtconsultorias.files.wordpress.com/2019/02/empresasconstructorasabril2016.pdf